ImageUP est une plateforme technologique de service de l’université de Poitiers, rattachée à l’UAR CNRS BioS 2038. Labelisée IBISA depuis 2025, ImageUP soutient la mise en œuvre de projets de recherche académique et privée principalement dans le domaine de la biologie, de la santé et de l’environnement, mais aussi des sciences de la matière. Installée sur 267 m², elle met à disposition des systèmes récents et des technologies avancées en microscopie photonique, microscopie électronique et cytométrie en flux spectrale.

Ses experts accompagnent et forment les chercheurs et les doctorants à l’acquisition de données et à l’exploitation des résultats. Ils peuvent réaliser des prestations de service, participent à la formation continue des personnels et étudiants et interviennent ou organisent des actions de médiation auprès du grand public.

Imagerie :

• Préparation d’échantillons biologiques et acquisition d’images en microscopie photonique conventionnelle, microscopie confocale, microscopie de super-résolution STORM, microscopie 3D à feuille de lumière, imagerie par FRET, FRAP, photoactivation et décageage, imagerie de phase et microscopie de conductance ionique pour l’imagerie topographique,
• Acquisition automatisée de lames virtuelles,
• Préparation d’échantillons et acquisition d’images en microcopie électronique en transmission et cryo-microscopie électronique à balayage pour l’imagerie de surface, les études 3D ultrastructurales et l’analyse chimique,
• Analyse et interprétation d’images,
• Formation à l’utilisation des équipements de microscopie et à l’analyse d’images.

Cytométrie en flux :

• Acquisition de données de cytométrie en flux conventionnelle ou spectrale,
• Assistance pour la conception d’expériences, le choix de marqueurs, le panel design et l’analyse de données multiparamétriques,
• Tri cellulaire par cytométrie spectrale, en tubes ou en plaques.

Microscopie photonique et confocale :

• Microscope à fluorescence de super-résolution STORM (Abbelight, Olympus) avec 4 lasers (405, 488, 560 et 640 nm), illumination TIRF, 2 caméras et système d’autofocus pour la détection de particules uniques,
• Microscope à feuille de lumière UltraMicroscope II (LaVision BioTec, Miltenyi) avec statifs macroscope et microscope, 4 lasers diodes (488, 561, 639 et 785 nm) et caméra refroidie Neo sCMOS (Andor) pour l’imagerie rapide 3D de grands échantillons biologiques transparisés,
• Microscope confocal à disque rotatif Revolution (Andor) avec acquisition de signaux en fluorescence et transmission au cours du temps pour l’observation de cellules vivantes nécessitant un environnement contrôlé en CO₂ et température, ou pour les études de FRET, FRAP, photoactivation et décageage,
• Microscope multispectral confocal FV3000 (Evident, Olympus) pour l’observation d’échantillons fluorescents sur de grands champs,
• Microscope de conductance ionique SICM (Ionscope) pour la réalisation d’images topographiques de la surface de cellules, y compris vivantes,
• Scanner de lames VS200 (Evident, Olympus) avec caméra couleur et caméra Orca Flash 4 (Hamamatsu) pour les échantillons colorés ou fluorescents, objectifs super-apochromatiques et support de 6 lames pour l’acquisition de type « lame virtuelle » automatisée et rapide,
• Microscope de phase SID4 Element (Phasics) avec caméra Zyla5.5 (Andor) pour la génération d’images de phase de cellules vivantes,
• Macroscope MVX10 (Evident, Olympus) pour l’observation de grands champs en couleur et fluorescence,
• Logiciels ImageJ, QuPath et Imaris pour l’analyse d’images.

Microscopie électronique :

• Cryo-microscope électronique à balayage 3D Teneo VolumeScope (FEI, Fisher Biosciences) avec système blockface pour les études ultrastructurales 3D, sonde EDX pour les analyses chimiques, navette de transfert VCT500 (Leica), cryo-plonge VCM (Leica), système de sublimation ou métallisation ACE600 (Leica), et module de cryo-fracture,
• Microscope électronique en transmission JEM 1010 (Jeol) avec cathode de tungstène précentrée, chambre-objet avec platine goniométrique et eucentrique, et caméra numérique Quemesa (Olympus),
• Ultramicrotome UC7 (Leica) pour la préparation d’échantillons,
• Logiciels Amira, MAPS et Dragonfly pour l’analyse d’images.

Cytométrie en flux :

• Analyseur spectral Aurora (Cytek) avec 5 lasers non colinéaires (355, 405, 488, 561 et 640 nm), 64 détecteurs de fluorescence et passeur de plaques automatique,
• Trieur spectral Aurora CS (Cytek) sous PSM II avec 5 lasers non colinéaires (355, 405, 488, 561 et 640 nm), 64 détecteurs de fluorescence et possibilité de tri en tubes de 1,5 à 15 mL ou en plaques de 96 ou 384 puits,
• Analyseur FACS Verse (BD Biosciences) avec 3 lasers (405, 488 et 633 nm) pour la mesure de 8 paramètres de fluorescence simultanés,
• Logiciels FlowJo, SpectroFlow et OMIQ pour l’analyse de données de cytométrie.

Outre les prestations quotidiennement effectuées pour les nombreux laboratoires et unités de recherche de l’université de Poitiers, du CNRS et de l’INSERM, ImageUP est également ouverte aux établissements extérieurs et aux sociétés privées parmi lesquelles :

• Université de Rouen – Microscopie électronique (Cryo-MEB 3D)
• Université de Brest – Microscopie électronique (Cryo-MEB 3D)
• B.Braun Medical – bio-matériaux (MEB)
• Qima Life Sciences – dermo-cosmétique (Microscopie Confocale et Cytométrie en Flux)
• Biocydex – pharmaceutique (MEB)
• Eurofins – Cerep – criblage de molécules actives (Microscopies)
• IFF Danisco – alimentaire (Tri cellulaire par Cytométrie en Flux)

ImageUP, plateforme d’Imagerie et de Cytométrie de l’université de Poitiers

Jean-François Jégou
05 49 45 36 45
jean-francois.jegou@univ-poitiers.fr

Site web de la plateforme : http://sfa.univ-poitiers.fr/imageup/

GIS IBISA : https://www.ibisa.net/plateformes-ibisa/imageup-752.html